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史
史寒朵
泓君：就AlphaFold的出现，以及它对生物学研究的影响和应用前景，与史寒朵博士进行探讨。
史寒朵：AlphaFold预测了绝大部分人类蛋白质组以及其他20种生物的蛋白质结构，并开源了数据库，这对于生物学研究具有里程碑式的意义。它可以帮助研究人员更快速地确定蛋白质结构和功能，从而节省研究时间和资源。例如，我之前研究的一个膜蛋白，如果早两年有AlphaFold的预测结果，我的研究项目可以提前一年完成。
但是，AlphaFold也存在一些局限性，例如它无法很好地预测一些具有无序结构的蛋白质。此外，AlphaFold目前只预测蛋白质本身的结构，距离药物研发还有距离，需要进一步预测小分子对蛋白质结构的影响。
虽然AlphaFold预测了98.5%的人类蛋白质结构，但仍有1.5%的蛋白质结构未被预测，而这些蛋白质结构恰恰是大家非常感兴趣的。
AlphaFold的出现加速了科研进展，但它并不能完全取代冷冻电镜等实验方法。冷冻电镜可以观察到更接近蛋白质生理状态的结构，尤其是在研究小分子对蛋白质结构影响时，冷冻电镜仍然是重要的工具。
AlphaFold的数据库公开后，可以帮助制药公司加快药物研发速度。未来，制药公司可能需要AI团队来辅助药物研发。
决定AlphaFold和其他算法好坏的关键在于计算资源。AlphaFold需要更大的计算资源，因此性能更好。
在生物学研究中，我们经常会绕开结构，通过猜测蛋白质功能，并设计实验来验证猜想。
AlphaFold的出现，降低了生物学研究的门槛，促进了跨学科合作。但是，跨学科合作也存在沟通成本高的问题。
肠道菌群研究是一个很有应用前景的方向，未来可以根据肠道菌群状况制定个性化膳食计划。粪菌移植在治疗特定疾病方面已经成熟，但用于减肥等目的风险较大。
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