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cover of episode 812: Studying the Evolutionary Diversity of Squishy Sea Creatures - Dr. Joseph Ryan

812: Studying the Evolutionary Diversity of Squishy Sea Creatures - Dr. Joseph Ryan

2025/5/12
logo of podcast People Behind the Science Podcast Stories from Scientists about Science, Life, Research, and Science Careers

People Behind the Science Podcast Stories from Scientists about Science, Life, Research, and Science Careers

AI Deep Dive Transcript
People
J
Joe Ryan
M
Marie McNeely
Topics
Joe Ryan: 我有两个孩子,他们占据了我工作之外的所有时间。我最喜欢和他们一起跳舞,这已经成为我们家庭生活的重要组成部分。我女儿喜欢 The Clash 的音乐,而我儿子则喜欢 Tiny Bubbles by Don Ho。此外,我也喜欢 Slim Whitman 的乡村音乐,并且我会弹吉他、鼓和键盘,尽管现在时间不多了。音乐不仅是我的爱好,也成为了我与孩子们互动和建立联系的方式。

Deep Dive

Shownotes Transcript

Dr. Joseph Ryan是佛罗里达大学惠特尼海洋生物科学实验室的生物学助理教授。Joe研究来自柔软的海洋无脊椎动物的DNA,例如栉水母(例如梳状水母)、刺胞动物(例如水母)、被囊动物(例如海鞘)和海参。他的目标是了解不同类型的动物是如何相关的,动物是如何适应极端环境的,以及动物是如何进化出我们今天看到的非凡多样性的。当他不工作的时候,Joe喜欢和家人一起度过时光。他和他的两个孩子喜欢跳着Don Ho的《Tiny Bubbles》和The Clash乐队的歌跳舞。Joe也是歌手兼作曲家Slim Whitman的粉丝,他演奏吉他、鼓和键盘。Joe获得了波士顿大学生物信息学博士学位。之后,他获得了美国国立卫生研究院国家人类基因组研究所的研究奖学金,随后在挪威卑尔根的SARS国际海洋分子生物学中心担任博士后学者。在我们的采访中,Joe分享了他更多关于生活和科学的内容。</context> <raw_text>0 大家好,欢迎收听《科学背后的人》播客。我是你们的主人,Marie McNeely博士,我很高兴你们能来到这里收听第812集,我们将重温我们与Joseph Ryan博士的采访。听众们,Joe研究来自柔软的海洋无脊椎动物的DNA,例如梳状水母、水母、海鞘和海参。他的研究目标是了解不同类型的动物是如何相关的,如何

动物如何适应极端环境,以及动物是如何进化出我们今天看到的非凡多样性的。在本集中,他分享了一些关于他在科学领域生活的精彩故事。所以准备好坐下来,放松身心,享受这期《科学背后的人》播客吧。

每天都有新的发现改变了我们对周围世界的理解。Marie McNeely博士将带您认识这些做出这些发现的杰出人物,让他们分享他们令人难以置信的故事,带您踏上奇妙的旅程。欢迎收听《科学背后的人》。大家好,欢迎收听《科学背后的人》播客。今天,我很高兴能与我们的嘉宾科学家Joseph Ryan博士交谈。Joseph Ryan博士

所以Joe,欢迎来到我们的节目。你好吗?很好。你呢?我很好,谢谢你的询问。感谢你抽出宝贵时间加入我们,谈谈你自己和你的工作。在我们深入探讨所有细节之前,我想先做一个简短的介绍,让我们的听众对你的背景有所了解。听众们,Joe是佛罗里达大学惠特尼海洋生物科学实验室的生物学助理教授。

他获得了波士顿大学生物信息学博士学位。之后,Joe获得了美国国立卫生研究院国家人类基因组研究所的研究奖学金。随后,他在挪威卑尔根的SARS国际海洋分子生物学中心获得博士后奖学金,进行了博士后研究。在今天的谈话中,Joe,我们将更多地谈论你的生活和你的科学。我想先谈谈科学以外的生活。所以

你能告诉我们,当你没有忙于工作的时候,你喜欢如何度过你的时间吗?嗯,我有两个孩子,一个一岁,一个三岁。所以除了工作之外,他们几乎占据了我所有的时间。我最喜欢和他们一起做的事情是跳舞。我女儿一岁,她喜欢The Clash乐队。所以我们喜欢跳他们的舞。我儿子三岁,他喜欢Don Ho的《Tiny Bubbles》。所以这是我们的必备歌曲。你最喜欢的必备歌曲是什么?

我喜欢这两首歌,但我喜欢Slim Whitman,他是一位经典的乡村约德尔歌手,直到几年前去世前,他一直住在距离这个地方大约一小时路程的地方。Joe,听起来音乐是你家庭生活中不可或缺的一部分。如果你对不同的歌曲和舞蹈感到兴奋,你会演奏乐器吗?我会。我会弹吉他、鼓和键盘。太棒了。不过现在不多了。是的。我想说你得为他们创作新的音乐来跳舞,对吧?是的。

很酷。很高兴能了解你科学以外的生活。听起来你有很多事情要忙,包括家庭生活,但我知道谈论你的研究也很令人兴奋。所以我们很高兴在节目中做到这一点。我最想先问人们的是,基本上是用一种易于理解的方式来描述他们所做的工作,这种方式对于那些可能不熟悉你工作的人来说也是可以理解的。Joe,你怎么向那些不熟悉你研究领域的人描述你的工作呢?

我告诉他们,我研究来自柔软动物的DNA,试图了解动物是如何进化出我们今天看到的动物形态的非凡多样性的。我喜欢你把它们描述成柔软的动物。对于我们那里的听众来说,有很多柔软的动物可供选择。你研究的一些动物是什么?我们研究栉水母、刺胞动物、海参和被囊动物。

现在,这是我们的四大类,但我们也研究过许多不同的动物。任何无脊椎动物对我们来说通常都很有趣。绝对的。听众们,如果你去Joseph的实验室网页,你会看到一些漂亮的水母图片,我对此印象深刻。谢谢。绝对的。所以我们刚才聊了聊你在工作中做什么,以及你在科学之外做什么。但我接下来想谈谈是什么激励了你。我认为

作为一名科学家,你有很多事情要做。你每天都要做很多事情。至少对我来说,拥有小的激励格言、引言和一些东西来帮助我度过难关非常有帮助。你有没有特别激励你的格言或谚语?

我不太喜欢那些引言,但我最喜欢的引言是Chuck Thompson说的,他长期担任巴尔的摩金莺队的播音员。他过去常说,“啤酒不冰吗?去打仗吧,Agnes小姐”,我不知道这是否激励了我,或者是因为它们有点随意而我喜欢它们。但每个人在你说这句话的时候,都多少知道它的意思。那么,在什么情况下你会想到这些引言呢?

“啤酒不冰吗?”就像当你遇到好事时,比如你的论文被接受了,然后当论文被拒稿时,你可能会说,“去打仗吧,Agnes小姐”。我喜欢。那么,这在你的实验室里流行起来了吗?学生们现在也这么说吗?没有。你得努力才行。我说的很多话,他们都理解,但他们不理解。明白了。

好吧,今天要传达给我们的听众一些很棒的引言。我还想谈谈一些可能激励或启发你的人。也许这位巴尔的摩金莺队的播音员就在其中。但你有没有在生活中仰慕的榜样或人物?

我试图模仿我对我的导师和朋友的钦佩之处。我在研究生院认识的一个名叫Adam Writes的人,他在北卡罗来纳大学夏洛特分校工作。他是一个非常聪明、非常冷静的人。而我往往会对事情感到非常激动和狂热。所以我试图控制自己的克制。也许这有点帮助。如果我没有这样做,我可能会完全脱离正轨。是的。

明白了。我自己也是那种A型人格的人,所以我必须做一些事情来让自己保持冷静、专注。所以我完全理解。是的。我的意思是,对事情感到兴奋很有趣,但在合适的人身边,保持冷静是很好的。是的。

绝对的。很高兴听到有人能帮助你保持冷静、专注。我很想知道更多关于你的工作,以及你对科学的兴趣是如何开始的,因为我认为听到这些关于开端的故事真的很有趣,可以了解科学家来自哪里,以及那些使他们走到今天经历。所以Joe,你能从一开始就带我们走过,告诉我们是什么首先激起了你对科学的兴趣吗?

在90年代初期,我曾经在巴尔的摩的一家酒吧餐厅蒸煮蓝蟹。我在上大学的时候做这个,我学习英语和历史等科目,无论我去哪里,我都喜欢这些科目。所以我辗转于马里兰州的五所不同的大学,最终从一所实际上已经不存在的社区大学获得了普通研究副学士学位。

然后我和一个在另一所学校学习商业的朋友交谈。我去那所学校,开始学习计算机。然后,在90年代中期,我和我在学校认识的一个朋友一起创办了一家网页设计公司。然后我做了一些奇怪的工作,为做豪华轿车的人做一些奇怪的网站。这些人从来没有真正付过我钱。我非常不擅长收钱。我意识到我需要一份工作。

所以我上了互联网,那时互联网还很年轻,去了一个公告板,找到了一份工作的广告,那恰好是美国国立卫生研究院的一份合同职位。但我不知道那是什么。我只是看到了计算机程序员。所以我去了那份工作,不知何故通过了面试。我在美国国立卫生研究院获得了一份合同职位,制作网络日历应用程序之类的东西。然后……

我刚在美国国立卫生研究院接触到研究,我就爱上了研究方面的工作。我也喜欢计算机方面的工作,但我对这些人正在做的事情更感兴趣。这就是一切的开始。太棒了。Joe,我想说这可能不是你从那些在科学领域找到职业的人那里听到的典型故事。所以,你年轻的时候有没有想过科学对你来说很有趣,还是直到你在美国国立卫生研究院工作后,你才觉得这非常吸引人?

如果我回顾一下我在学校的科学老师,我认为我从来没有一个很棒的科学老师。我有一些非常棒的人文老师和一些非常棒的数学老师。我一直倾向于选择他们,因为我真的认为是老师在那个水平上创造了这个科目。所以直到我偶然得到这份奇怪的工作后,我才开始考虑科学。所以一旦你在美国国立卫生研究院发现你对这个感兴趣,你的下一步是什么?

我在那里,我被带入项目中来处理数据。我得到了输入,并被告知输出应该是什么样子。我一直在做这些事情。但人们开始问我,帮我建立一个系统发育树。我说,这听起来很酷。我想建立它。我会去找我的主管,说,“嘿,我想建立这个系统发育树。”他们说,“你并没有真正做这些事情的必要背景。所以你不能这样做。”我对此感到非常沮丧。

然后我开始研究如何获得那个背景,然后去读研究生。太棒了。那么,为什么选择波士顿大学读研究生呢?

当时他们刚开设了一个生物信息学项目。事实上,我有点想去一个有良好山脉的地方,因为我当时非常喜欢单板滑雪。所以我实际上被不列颠哥伦比亚大学录取了,那里是北美最好的山脉之一。所以我打算去那里。我的父母非常沮丧。我们

我们当时有一些健康问题,他们不希望我离家那么远。所以我去了波士顿,但这结果很好。我能够去那里获得我需要的生物学知识,并依靠我拥有的计算技能生活。绝对的。那么,当你快完成研究生学业时,你在想下一步是什么,你是如何做出决定的?

在研究生院,除了最初几年之外,我没有得到资助。然后我教了很多课。我和我以前在美国国立卫生研究院的主管谈过,可能和他一起完成我正在做的事情,完成我的学位,然后继续和他一起做博士后。他对这个想法很感兴趣。

所以我刚在美国国立卫生研究院完成学业,就开始和他一起工作了五年。太棒了。听起来人脉关系起了作用。是的,很好。非常酷。然后你得到了一个去挪威进行博士后研究的机会。你能告诉我们一些关于这段经历的事情吗?我读了一本书。就像一本关于我的生活和科学的传记。书中的人物在国外做过博士后。

所以我开始寻找国外的机会。这是你没有机会做的事情。所以如果你有机会,你应该去做。所以我四处寻找,我发现这个实验室对同样的问题很感兴趣,但研究的动物不同。我一直从事刺胞动物和栉水母的研究,仅此而已。

所以我去了这个实验室,它研究了大量的无脊椎动物。我在那里学到了很多动物学知识。在那里也是一次非常棒的经历。太棒了。而且我想在挪威卑尔根也很漂亮。是的。当阳光明媚的时候,虽然时间不多,但当阳光明媚的时候,它真的令人难以置信。太棒了。对于我们那里的听众来说,我知道你提到你与刺胞动物和栉水母一起工作。这些生物是什么?你能描述一下它们,让大家能看到它们的样子吗?

刺胞动物,大多数人是从珊瑚、海葵、真正的水母那里熟悉的。栉水母经常与水母混淆,但它们与刺胞动物的关系并不密切。它们是水母,身上有八排梳状结构,用来运动。很多时候,如果你在水族馆看到它们……

它们会有灯光照射在这些梳子上,使它们看起来像彩虹一样。它们看起来非常棒。太棒了。听起来你到目前为止的职业生涯都非常顺利。你在这一路上有很多不同的经历。所以当你回想起来的时候,你是否觉得你在计算机编程方面早期所做的工作以及涉足很多不同的事情,是否影响了你的科学研究,或者帮助了你目前的工作?

是的,我认为在开始考虑我正在做的工作之前,走一条非传统的科学道路,并长时间思考很多其他事情。我觉得我思考问题的方式与其他人可能有所不同。我不知道是不是每个人都这么觉得,但可能有一些东西。

绝对的。据我了解,除了你所做的研究之外,你还做了很多外展工作,走出去接触社区,分享你的工作。你能谈谈你的一些经历和一些努力,让你接触社区,特别是年轻人参与科学吗?

所以每年二月的达尔文周,我们都会出去。这个想法有两个方面,一是进行外展,二是进行实验室团队建设和培训,我把它想象成一次摇滚巡演。所以当一个乐队巡演时,他们通常会在家里进行第一次演出。演出有时是他们在解决问题,就像……

你看到他们演奏,你会想,“哦,这还不错。还可以。”是的。然后他们上路了,砰砰砰砰砰。他们每晚都在演奏同样的歌曲,一个月或一周后,或者无论巡演持续多久,他们都会回来。你再次看到这个乐队,就像,“嗖”。他们只是让你震惊,因为他们只是把事情安排好了。

我的想法是让我的实验室进入这种模式:让我们每天都做同样的演讲,持续一周。所以我们去高中、初中和大学、学院,任何愿意接待我们的人。我们去那里,简单地谈谈达尔文。然后我们谈谈我们的研究。

我通常会做一个关于达尔文的简短介绍,然后介绍我的学生,说,“好吧,这就是我们正在研究的东西。”他们与达尔文的研究有直接的关系,有时我们会介绍过去不同的进化生物学家。非常酷。我们在介绍中提到你会演奏一些乐器。你以前在乐队里待过吗?是的,我待过。这是否受到了你乐队经历的启发?其中一部分是在观众席上,当你的朋友的乐队,你去,我们看到他们,你

你之前看到过这种前后对比,然后进行一些巡演,看看这个过程在路上是如何进行的,在乐队里,谈话,等等,情况如何?让我们尝试调整一下,等等。我们试图将它融入系统。我也……我的实验室里没有音乐家,但我有一件事,我想和他们一起创作一首歌曲,让他们演奏非常简单的东西。但是……

这是我众多疯狂的想法之一,我需要找到时间去做。我喜欢。好吧,我们已经暗示了你正在你的研究实验室里做的一些很酷的事情,但我还想更详细地谈谈你的一些项目。所以,Joe,你现在有没有一个你特别兴奋并想告诉我们的项目?

当然。我真的很兴奋关于栉水母的这些疣,部分原因是它们被称为疣。它们不是传统的疣。我不得不查一下。是的。是的。这些栉水母的全身都有这些凸起。所以如果你观察它们,它们看起来像这些小白点,包括我自己在内,没有人真正花太多时间试图弄清楚这些东西是什么。我从来没有真正想过这些疣。

然后在过去的几个月里,我开始和实验室里的一位神经科学家一起工作。我告诉他检查一下这组细胞,在60年代,人们认为它们是感光细胞。然后当我们进行基因组测序时,我们与Christine Schnitzler进行了一项研究,她专注于这些细胞,并表明它们也表达视蛋白。

所以它们被认为是感光细胞,结果它们很可能是感光细胞。无论如何,我说这些将是一组很酷的细胞,可以在更详细的层面上进行研究,例如那里是否有神经元以及这些神经元在做什么,等等。他说,“好吧,酷,然后观察它们,说,“这些观察起来不太好。但这些疣真的很酷。”哦,是的。

所以我们一直在观察它们,它们对光敏感。所以如果你照射它们,它们会摇晃。如果你向它们喷洒一些鱼内脏,它们也会做出反应。如果你敲击显微镜,并通过水发送振动,它们也会做出反应。所以它们对不同类型的输入非常敏感。它们位于身体表面。所以我们认为它们是一种感官系统,这种系统还没有被研究过。

关于疣的另一个很酷的事情是,关于栉水母神经系统起源的问题。它是否与其他动物的神经系统分开出现?疣非常不错,因为那里只有大约500个细胞,它们有神经元,它们有肌肉,我们可以真正地计算出电路,计算出那里存在的基因。

然后与我们自己的神经系统或老鼠、苍蝇或其他任何生物的神经系统进行比较,看看它们有什么共同点,有什么不同。它们完全独立是否有意义?所以如果它们拥有所有其他生物都没有的基因,而这些基因是它们用于神经系统的,那么它们将是独立的。但我们怀疑它们可能使用的是相同的基因组。

非常酷。现在我必须问,在一个生物体中,一个栉水母,每个疣都有相同的细胞和相同的功能,还是它们在身体周围是专门化的?

它们的大小略有不同。我们还没有仔细观察它们,但我认为它们可能都一样。如果你取动物身上最大的疣,那么你可能已经捕获了任何其他疣中存在的每一个细胞。但你可能会发现一个小的疣,它可能还没有所有东西。明白了。那么这种结构是栉水母特有的吗?你在其他生物体中见过类似的东西吗?

你问得很有趣。这是最新的消息吗?这对我来说是新的,也许对听众来说也是新的,但海参显然也有疣。她给我发了一张照片。她说,“看看这些疣。”我们整个实验室,即使是不研究栉水母的人,也开始有点疣狂热了。嗯哼。

我们还将其与鱼类的侧线进行比较,因为鱼类有这些毛细胞,就像我们的耳毛细胞一样,它们以此来感知环境。所以他们用它来研究鱼类如何对捕食者做出反应,例如。当这些毛细胞发生偏转时,它会发出信号,等等。所以很多动物在身体表面都有这种感官系统。明白了。所以,Joe,接下来对这些迷人的疣的研究是什么呢?

我喜欢这句话。好吧,我们将要做的是,我们将分离这些疣,对它们进行成像,并对它们进行记录,你实际上可以记录通过它们的电信号,然后对单个细胞进行测序。所以我们将能够说这个细胞是这样的,因为我们有它的图片。我们知道它对神经递质如谷氨酸敏感。

我们知道在该细胞中表达的基因是等等,这个通道或这个受体或这个突触的东西,等等。所以我们将建立一个地图集和地图,说明疣在疣内是如何交流的,以及疣是如何与其他疣交流的,或者它们是否与其他疣交流。所以它基本上就像基因和电路。

非常酷。好吧,听起来你还有很多工作要做,你和你的学生们也是一样。确实。

这些可能是巨大的挑战或失败,也可能是路上的小障碍。但我喜欢在我们的节目中谈论它们,因为我认为让我们的听众了解做科学和成为科学家是什么样子非常重要。所以Joe,你有没有经历过挑战、失败或艰难时期,你可以带我们走过并告诉我们你是如何克服的呢?

我真的不知道有什么重大的失败或类似的事情,但我每个月或每两个月都会有一份拨款申请被拒绝。我们不断地提交申请,然后它们不断地被拒绝。偶尔……

或者一旦它们获得资助。这是一个持续的斗争。没有人能获得所有资助,也没有人能发表所有论文。所以这是一种你很快就能掌握的技能,就像厚脸皮一样。绝对的。所以对你来说,有没有一个特别让你心爱的提案,你对此非常兴奋,但没有获得资助,你可以告诉我们吗?

好吧,我们有一个提案。它现在正在进行中。同样,这是我们第四次提交。我们第一次提交时,我们得到了很好的评价,只是错过了截止日期。我之后提交的另外两个完全被糟糕地否决了。天哪。所以这有点像,“发生了什么?”我们几乎成功了。但我认为我在那里学到的一件事是,我回去更仔细地阅读了评论,我认为

第四次,并意识到我们可能没有解决所有问题。我们立即解决了某些问题。我们想,“我们已经做到了这一点。你说我们不能做到这一点,我们已经做到了。”所以我们专注于这些事情。但我认为我们只需要更详细地回应。所以这次希望成功。

绝对的。我和我们的听众都在为你加油。所以Joe,你能告诉我们你是如何处理这种情况的吗?就像你说的,每个人都会遇到论文被拒或拨款被拒的情况。你是如何反弹的,或者你是如何处理坏消息的?

幸运的是,总有足够的工作让我做四份。所以我通常没有太多时间去沉思它。这有帮助。是的。是的。但考虑到系统的运作方式,如果每个人提交的申请都获得批准,那就会变得疯狂。是的。将没有钱去做。

对。所以这就像,“好吧,这就是它的运作方式。”然后从另一边来看,我们正在进行拨款评审,你必须设置它。所以真正好的看起来真的很好,而那些很棒但不如最好的东西必须指出它们的问题。

你从桌子的另一边看到了它,所以你可以合理化。我认为这有帮助。是的。好吧,感谢你分享你的一些挣扎和失败。我认为,就像我们所说的那样,让大家意识到他们并不孤单非常重要。这些失败不仅仅发生在你身上。每个人都在经历它们。所以感谢你与我们分享你的故事。但我们不想只关注困难时期,Joe。接下来我想让你告诉我们你取得的一些成功。这可以是一个巨大的胜利,甚至只是一个对你特别有意义的小胜利。

我的实验室里有一位博士后,我们最近一直在思考科学中的僵局。所以一组人会查看与另一组人相同的数据,并得出相反的结果和结论。这是怎么回事?

在科学中。我觉得不应该这样。是的,应该有一个正确的答案。应该有一个正确的答案。我们都在查看相同的数据。那么发生了什么?我们认为,尤其是在进化生物学或系统发育学中,你实际上是从数据中构建树木

构建树有很多方法,而且总有新的方法出现。所以这变得很困难。你总是可以这样辩解:这棵树是错的,因为我的方法是错的。我要尝试另一种方法。然后结果就出来了,或者其他的什么。所以我们得出结论,我们需要一些类似于临床试验的东西。所以直到大约过去十年,临床试验是这样的:大约50%的临床试验结果是,哦,是的,这完全有效。

然后人们会说,等等,不可能所有的事情都奏效。所以他们制定了一个计划,说在做之前,规划好所有步骤非常重要。你的统计数据是什么?判断这实际上有效的标准是什么,等等。然后你把它提交给审查委员会,然后他们会批准它。然后你出去做这项工作,你做的和你说的完全一样。然后他们发现成功率从50%下降到5%。

如果我们在生物遗传学方面做类似的事情,在我们进行研究之前,精确地说明我们将要做什么,我认为一些僵局实际上会解决,因为其中一些事情是由确认偏差驱动的。确认偏差并不总是坏事。这只是我们都在某种程度上会做的事情。对。

所以我们在我们的实验室里实施了一年,效果非常好。这很酷,因为它还有许多其他意想不到的优势。比如它是一个很好的培训工具。所以我们把这个系统命名为phylotocol。它就像系统发育学的协议。我们带了一个暑期本科生,我们在暑期开始的时候和她坐下来,制定了一个phylotocol。这是你的项目,这就是我们将如何去做。带她走过所有步骤。

然后给她phylotocol。然后她很快就完成了。我认为正是我们工作的方式,phylotocol确实起到了帮助作用。所以我们把它写成一篇手稿,它被我们想发表的期刊接受了,这样人们就能看到了。与此同时,这篇论文在年底12月31日发表了。科学中的透明度问题也正在以同样的速度迅速发展。它

所以它在空气中。在过去的十年里,可重复性一直是一件大事。你做了所有这些分析。告诉我们生成这些数据所使用的命令行是什么,等等。我认为该领域在采用这种方法并使其更容易重复工作方面做得非常好。但我认为这是这种透明度的下一波浪潮,在做之前明确说明你将要做什么,为什么你改变了你的计划,等等。

绝对的。听起来这是一篇非常及时的论文。我们将看看人们是否会采用它,或者至少考虑它,即使他们没有做任何正式的事情,但会更清楚地认识到这个问题。当然。我自己也来自更临床的科学背景,我会说这些协议非常有用,因为你必须提前考虑好所有事情。我认为,这样一来,你遇到的问题就会更少。所以我认为采取这种方法并将其应用于你自己的研究,可能会帮助你避免未来的陷阱。

绝对的。我们会想到一些我们以前可能没有想到的事情。因为当你计划的时候,你会想,如果我们得到一个我们认为是错误的结果怎么办?那时我们该如何处理?然后你被迫考虑所有这些可能性。但我认为它们非常有用。而且你确实设计了一个更好的研究。而且我认为,你对你在研究什么会有更好的感觉。

太棒了。那么,祝贺你和实验室发表了这篇精彩的论文。听起来它刚刚发表,并且开发了这个phylotocol,我喜欢这个名字,这个系统可以帮助你的研究领域和你的实验室的具体研究。我们已经讨论了你生活中的一些不同方面,包括科学内外。我想暂时跳出科学领域的一件事是,你是一位科学家。

你正在读什么,约瑟夫。我喜欢从我们节目的每一个人那里获得书籍推荐。所以你有没有读过一本你最喜欢的书,想推荐给我和我们今天的听众,无论是科学书籍还是非科学书籍?

好的。我喜欢经典作品。我和实验室的一个学生谈论我最喜欢的书,她建议我看看《基督山伯爵》。所以我正在读,或者说我在听。我不,我听很多书,我大概在第110章左右。

它非常长,但很棒。这是一个承诺。是的,它都是关于复仇的,我不知道我是否特别爱复仇,但它非常棒。太棒了。我们将把它列入我们听众的书单。你其实是第一个推荐这本书的人。事实上,我们没有收到很多经典作品的推荐。所以这太棒了。然后我必须问,你一岁和三岁的孩子现在最喜欢的书是什么?

我想说我最大的孩子喜欢超级英雄。所以我们收集了一套超级英雄的书,我只是把词改了,而不是关于恶棍之类的东西,我们谈论冰沙,他生我的气。我告诉他,闪电侠坐在蝙蝠侠的三明治上。他说,那不是书上说的,爸爸。

然后我最小的那一个喜欢《皮特猫》系列的书。很棒的推荐。我喜欢。他们的品味很好。很高兴听到你正在读什么。我们将把你的推荐,《基督山伯爵》放在我们的网站上,供我们的听众阅读。在我们的谈话中,我们已经触及了你的一些机会,约瑟夫,为了你的工作而旅行。我认为这是科学职业的一个伟大方面,人们可能没有意识到这是职业的一部分。所以你有没有一个你去过最喜欢的地方,是为了科学?

2010年,我去哈佛参加了国际无脊椎动物形态学大会。当时我们正在进行TINA4基因组项目大约两年了。我和我的合作者克里斯蒂·施尼茨勒,我们当时都是NIH的博士后。我们参加了这个会议,她的一位朋友说,你在研究TINA4生物发光。哈佛大学有一位伍迪·黑斯廷斯,

他是最早研究栉水母生物发光的人之一,也是该领域的先驱之一,所以你应该去和他谈谈,所以她给他写信,然后我们去和他谈论基因组,他对我们所做的一切基因组方面的工作都非常感兴趣,并想听听所有这些事情,我们和他进行了大约两三个小时的非常愉快的交谈,我

谈话结束后,他带我们走进一个步入式培养箱,然后关掉了灯。我们只是和这位85岁的老人一起坐在黑暗的培养箱里呆了一会儿。这真的很奇怪。然后他开始敲打架子,所有的东西都开始闪烁和亮起来。哦,哇。然后他开始旋转烧瓶,所有的东西都像……

是的,是的。所以我们离开了会议,我们想,哇,那是什么……发生了什么?这是有史以来最酷的事情。我们需要这样做。首先,栉水母生物学家是最酷的,对吧?所以我们需要找到他们所有人。碰巧我们会议结束后要去伍兹霍尔与我们的合作者会面。我们认为查找其他栉水母生物学家会很酷。所以我们在HUI遇到了拉里·梅登和里奇·哈比森,在MBL遇到了西德·谭,并且

只是听到了关于栉水母的所有这些非常酷的故事。这是最好的事情。所以我们进行了这些精彩的、鼓舞人心的谈话,然后回去开始努力工作。

这太棒了。我喜欢这个故事真正突出了你与你所在领域的其他科学家之间建立的这些联系或纽带,你以前从未见过他们。我想,一百万年内,普通完全陌生的人都不会说,嘿,来我的实验室吧。我们会坐在黑暗中。我认为这是科学界真正特别的东西。是的,我认为接触资深先驱群体,如果你正在做一些属于他们领域的事情,他们会感兴趣。我

我记得一些具体的事情会突然出现在我的脑海中,我想,哦,是的,这是从和哈比森谈话中得到的。他提到了这件事。所以这些谈话非常有价值。绝对的。谢谢你分享你这次难忘的旅行经历。在我们的谈话中,我们谈到了你自己的研究实验室里发生的一些古怪的事情。我喜欢……

分享科学中的人性一面,因为我认为有些人仍然在脑海中保留着媒体或其他地方对科学的印象。我认为现实通常与人们的刻板印象不符。所以科学家很有趣。他们很有趣。他们在实验室外也有兴趣。我认为这需要强调,人们需要真正欣赏科学。

所以我喜欢分享科学的人性一面,无论是古怪的传统,还是有趣的回忆,或者你与同事一起做的令人难忘的事情。所以,约瑟夫,你有没有一个故事,真正体现了科学的人性一面?

我们在我的实验室里有一件叫做FOMOM仪表的东西,它就像这个发现会让我们多么出名。我们并不是真的想出名,但我们经常开玩笑说我们会多么出名。所以如果有人说,嘿,看看这个结果,它真的很好,那么有人会说FOMOM仪表真的在震动。对。

这就是我们的事情。我喜欢。所以你有没有一个实际的phomomenator图表,你可以用来绘制图表?我们需要一个。

你可能需要。是的,我真的很需要做一个,我已经威胁过几次了,但是……你必须把它委托给某个人,对吧?没错。它只是一些纸板。一个小标记,你就完成了。是的。这听起来像是一个下午的实验室活动。确实。那么,你遇到的最高的事情是什么,让温度计达到顶峰?哦,我不知道。我们认为会让我们出名的一切都没有让我们出名。然而,对吧?是的。

它没有让我们达到5、6、7、8、9的范围,但有时我们会达到2的范围,我想。这是一个10的量表吗?是的。好的,公平。还有其他故事、传统或其他你想与我们分享的东西吗?你会认为我们在我的实验室里会做更多奇怪的事情,但是……它们只是秘密的奇怪的事情,没关系。

好吧,谢谢你分享了你们实验室的一个有趣的传统或一种持续的实验室笑话。我认为你确实需要对这个温度计有一个物理上的体现。所以当你拿到它的时候,给我寄张照片。好的。好吧,约瑟夫,很高兴和你聊聊你正在做的工作,你的实验室里发生了一些非常酷的事情,听起来那里有一群很棒的人。但我认为总有一些事情阻碍着你,让你无法在你的实验室里做你想做的那些令人惊叹的伟大的事情,并回答那些重大的问题。

所以我喜欢让研究人员在这里和我一起做梦。所以,约瑟夫,如果我给了你所有你在科学中可能要求的东西,无论是资金、员工、技术还是可行性,如果我给了你一切,你最想回答的问题是什么,或者你最想解决的问题是什么?

这是一个难题。我对染色体性别决定是如何发生的感兴趣。我觉得我们最终会知道,但现在我们没有很多基因组。即使我们有,很多时候我们甚至不知道从基因组中是否有一个像人类中看到的XY系统,或者其他动物中看到的其他系统。

但是我们可以做的一件事是,对整个动物界的雄性和雌性进行测序,即使我们以较低的测序率进行测序,然后进行减法操作。所以把所有东西都与所有东西对齐,然后说,哦,在这个物种中,雄性有一些额外的DNA。

而这些额外的DNA上的基因在这里。在这个物种中,雌性有额外的DNA。而这些染色体上的序列在这里。然后如果你把所有这些数据放在一棵树上,我认为会有一些非常有趣的模式出现。所以即使没有无限的资金,这也是可行的,但这需要一些资金和人员来收集这些数据。是的,还有时间,这是一个宝贵的资源。你不能低估。是的。所以这是你目前在实验室里正在进行的一些工作吗?

我有一些雄性和雌性的基因组,所以我做了一点。但你也需要有人能够在细胞上工作,来观察染色体。这就是这个项目目前所处的位置。我四年前做了这项工作,除非有一个学生来,否则我看不到很快就能完成它。听众们,这就是你们出场的地方。

我喜欢。好吧,谢谢你向我和我们的听众介绍了一些有趣的事情,让我们今天思考。你与我们分享了这么多,约瑟夫,但我还想问你一件事情。那就是一条建议。在你的一生中,有没有人告诉你一些真正帮助过你的事情,你可以传授给我和我们的听众,在我们自己的生活中使用?

我问我的博士生导师,我们要参加一个会议,我说,我有一个关于……的想法。在会议上和人们谈论这个可以吗?他告诉我,想法很廉价,我应该告诉每个人所有的事情,如果你在一个有很多人在研究同一个问题领域的领域,这可能很难做到。但是当你研究奇怪的动物和奇怪的问题时,通常只有一小群人,而且工作量很大,以至于人手不足。

所以最好是说,嘿,我在考虑这个,我在考虑那个。你最终会有人告诉你这是一个糟糕的主意。你永远不应该那样做。或者这是一个好主意。你知道,如果你也这样做会很棒。但是你仍然可以感觉到有些人没有这种观点,他们把自己的想法藏得很紧。没关系。但这似乎会不那么有趣。偶尔,有人会偷走一个主意,但没关系。

好吧,我认为如果所有这些人都互相交谈,分享想法,科学就能更快地发展,因为这个群体可能已经解决了问题的一部分,而这个群体解决了问题的另一部分。如果他们只能互相谈论它,你就能更快地找到解决方案。

是的。很多时候就像,我永远无法做到这一点,因为我有很多事情要做。所以如果有人这样做,我会非常兴奋。好吧,约瑟夫,给我们的听众关于开放和分享他们在科学中的工作的建议非常棒。我认为这在今天非常重要。所以如果我们的听众想和你联系,分享他们的一些想法,或者了解更多关于你正在做的事情,他们应该去哪里,或者他们如何了解更多信息?

如果他们愿意,他们可以给我打电话。我的号码是904-461-4046。太棒了。好吧,听众们,如果你有任何问题,一定要联系。约瑟夫,非常感谢你今天加入我们的节目,并分享你故事的一部分。感谢你们的邀请。这很有趣。很高兴和你聊天。听众们,很高兴你们和我们在一起。我们下次再见,在《科学背后的人》的另一集中。