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Episode 103: Neo-Darwinism vs Post-Darwinism

2025/2/25
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The Theory of Anything

AI Deep Dive Transcript
People
B
Bruce
P
Peter
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Bruce: 本期节目讨论了新达尔文主义和后达尔文主义的差异。新达尔文主义是一种以基因为中心的进化观,它将自然选择与遗传学、古生物学甚至人类心理学统一起来;而后达尔文主义则强调了随机突变之外的因素,例如表观遗传学或生物体和细胞可以以有益的方式改变自身基因组的观点。我主要关注生物学家詹姆斯·夏皮罗对理查德·道金斯新达尔文主义的批判性研究。我们探讨了将细胞、身体和思维视为受主基因控制的工具是否合理,以及后达尔文主义(也称为“第三种进化方式”)是否为新达尔文主义和智能设计论提供了一种有意义的替代方案,以及这种看待生物学的方式是否揭示了现实的本质甚至物理定律。我对丹尼斯·诺布尔的著作评价不高,但欣赏他的一篇论文。我更欣赏詹姆斯·夏皮罗的著作,他以具体的生物学实验为论据阐述观点。我认为夏皮罗的观点有其意义,但他的理论也存在一些致命的批评。我认为新达尔文主义需要修正,但这也并非新观点。进化论存在一些未解决的问题,夏皮罗的工作尝试解决这些问题。许多进化论者对进化论中存在的不足视而不见,阻碍了问题的解决。一些科学家也指出了进化论中的不足,并试图提出新的理论来解决这些问题。夏皮罗批评道金斯过于武断地宣称自己拥有唯一正确的答案,这反而强化了创造论者的观点。道金斯的做法强化了创造论者的观点,认为进化论者更关心攻击宗教而非理解进化。进化论者做出绝对的陈述,不利于解决争议。夏皮罗对道金斯的批评可能存在断章取义之处。道金斯在与宗教人士论辩时,态度不够真诚。夏皮罗对道金斯在与宗教人士论辩时的态度的评价,我基本同意。道金斯是一位伟大的科学家,但我认为他在处理进化论与智能设计论的争议时,态度过于教条。夏皮罗的观点并非我的观点,但我同意他的某些看法。夏皮罗试图解决进化论中的一些具体问题,而不是仅仅为了赢得论战。夏皮罗被认为是“隐性智能设计论者”,但他本人对智能设计论持批判态度。夏皮罗批评智能设计论者诉诸超自然干预来解释生物结构的起源。夏皮罗批评进化论者陷入近乎宗教狂热的状态。夏皮罗试图通过修正新达尔文主义来解释一些复杂的生物结构的进化。为了更好地理解夏皮罗的观点,我将详细解读他的论述,而不是仅仅进行总结。夏皮罗对新达尔文主义/现代综合理论的主要异议在于,该理论忽略了基因组重组等因素。传统的新达尔文主义观点认为,表型信息完全包含在基因中,只能通过逐个碱基对的突变来改变。根据“自私的基因”观点,生物体仅仅是基因复制的工具。夏皮罗指出,学校里教授的新达尔文主义进化论过于简化,忽略了杂交等重要因素。物种内的自然变异往往会随着时间的推移而平均化。达尔文为了解决物种变异问题,提出了血液中存在遗传变异的假说。学校里教授的进化论强调渐进主义,即通过单个突变来产生变异。夏皮罗指出,渐进主义的进化速度太慢,无法解释现实中的生物进化,杂交可以迅速产生大量的变异。夏皮罗认为,进化的新颖性来自于不同物种之间的杂交。基因组数据可以用来检验达尔文的渐进主义理论。杂交可以导致快速物种形成,这与渐进主义的观点不符。基因组研究表明,种群中较高的遗传变异性通常来自于不同物种之间的基因渗入。杂交可以导致全基因组加倍,从而在单代内产生新的物种。杂交可以在单代内产生新的物种,这比传统的自然选择快得多。杂交是产生物种变异的一种快速方式,这与学校里教授的渐进主义进化论不同。如果基因是构建表型的特定程序,那么基因加倍应该会造成混乱,而不是产生新的物种。杂交并非新观点,但其重要性常常被低估。为了理解进化的有效性,我们需要更好地理解杂交等非渐进主义的进化方式。杂交是一种在压力下发生的快速进化方式,它与传统的渐进主义进化论不同。杂交可以被理解为生物体或物种对压力的反应。在压力下,不同物种的生物体可能会杂交,从而产生新的物种。研究表明,压力条件与基因组重组功能的激活有关,这可以产生具有复杂新表型的生物体。在压力下,物种会做出导致基因组快速变化的决定,从而产生新的物种。杂交仍然可以被认为是自然选择的一种形式,但它与传统的渐进主义进化论不同。进化论理论家们完全排除了基因组变化与生命体验之间的任何联系。夏皮罗的另一个更具争议性的反例是超级细菌。夏皮罗认为,垂直基因转移的观点无法解释超级细菌的快速进化。对细菌耐药性的研究表明,科学事实不仅仅是实验验证假设预测的结果。传统的观点认为,细菌耐药性是通过多个连续突变积累而产生的。实验室实验验证了细菌耐药性是通过多个连续突变积累产生的观点。然而,现实世界中的细菌耐药性传播速度远超预期,这与传统的观点不符。1967年美国卫生局长的声明表明,对细菌耐药性的预测是错误的。细菌可以同时对多种抗生素产生耐药性,这与传统的观点不符。细菌同时对多种抗生素产生耐药性,这与传统的渐进主义进化论难以解释。细菌耐药性的产生可以通过水平基因转移来解释。多重耐药性可以通过质粒在细菌之间水平转移来解释。水平基因转移可以导致生物体同时获得多个性状,从而实现快速的进化。细菌和其他微生物进行大量的水平基因交换,并具有天然的基因工程机制来整合和重排这些水平获得的DNA。夏皮罗提出了“自然基因工程”的概念,认为生物体可以改变自身的DNA。“自然基因工程”是一种非超自然的过程,它解释了生物体快速进化的一种机制。CRISPR技术是细菌天然基因工程机制的一种体现。生物体可以通过学习算法在一生中获得知识,这与DNA中的知识不同。生物体的细胞具有学习算法,可以在其一生中对DNA进行修改。免疫系统是生物体细胞学习算法的一个例子。生物体可以通过水平基因转移获得新的性状,这与垂直遗传不同。水平基因转移可以导致生物体同时获得多个性状,这与传统的渐进主义进化论不同。超级细菌的例子表明,细菌的进化方式与传统的渐进主义进化论不同。细菌利用水平基因转移来获得耐药性,但这仍然可以被纳入新达尔文主义的框架。细菌的自然基因工程能力超出了我以往对新达尔文主义的理解。夏皮罗的“自然基因工程”概念存在争议,后续节目中将讨论其批评意见。夏皮罗的研究表明,大肠杆菌的突变方式与传统的渐进主义进化论不同。夏皮罗的研究表明,大肠杆菌可以以意想不到的方式改变自身的基因。大肠杆菌的性重组需要一种叫做F因子的感染因子,这种因子可以比细菌的复制速度更快地复制和传播。质粒是一种可以自主复制的DNA分子,它可以加速基因的水平转移。转基因植物的例子说明了水平基因转移的风险。转基因植物的DNA可以通过昆虫、细菌或真菌等途径水平转移到其他物种中。 Peter: 道金斯和丹尼斯·诺布尔之间关于进化观的辩论很有启发性,道金斯对诺布尔的观点持开放态度。丹尼斯·诺布尔的观点因其与道金斯的辩论而受到关注,但媒体报道常常夸大其词。 supporting_evidences Jane Doe: 'Another original English quote...'

Deep Dive

Shownotes Transcript

This week we discuss neo-Darwinism vs post-Darwinism. Neo-Darwinism meaning a gene centric view of evolution, which is also called the great synthesis since it unifies natural selection with genetics and paleontology and perhaps even human psychology.

Post-Darwinism is a view that emphasizes factors outside random mutation, like epigenetics or the assertion that organisms and cells can alter their own genome in a beneficial way.

Here Bruce specifically concentrates on the work of biologist James Shapiro’s critical look at Richard Dawkins’ neo-Darwinism.We consider, does it really make sense to see our bodies and minds as tools governed by our masters DNA? Does post-Darwinism, also called “third way evolution,” offer a meaningful alternative to both neo-Darwinism and the theism of intelligent design? Does this way of looking at biology say something about the very nature of reality and the laws of physics?

This is part 1 of a loose series. Part 2 will cover criticisms of Noble and Shapiro. Part 3 will cover the work of Michael Levin. However, you don't really need to listen to them in order and we provide context each time.

James Shapiro's Evolution: A View from the 21 Century)

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