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S6E37|如果 AI 就能解锁蛋白质,世界还需要结构生物学家吗?

2022/11/9
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What's Next|科技早知道

AI Deep Dive AI Chapters Transcript
People
刘灿
国才
张璐
推动太空投资和提供深入行业分析的风险投资专家。
Topics
刘灿:AlphaFold 的出现引发了结构生物学家是否会被取代的讨论,AlphaFold 在蛋白质结构预测领域的突破速度远超以往,改变了生命科学领域的研发速度。 国才:AlphaFold 等人工智能技术正在改变药物研发模式,从实验科学向计算科学和合理设计转变,数据驱动取代了经验驱动。人工智能在药物研发各个环节参与,主要集中在药物发现阶段,包括靶点发现、先导化合物筛选和化合物优化。AlphaFold 开源算法和数据集对全人类做出了巨大贡献,加速了新药研发和疾病研究的进展。AlphaFold 的预测结果可以促进对现有实验数据的理解,例如冷冻电镜和X射线数据。AlphaFold 提供的蛋白质结构预测结果需要结合实验数据进行验证,不能完全替代实验手段。 张璐:AlphaFold 的开源数据库和代码促进了其在科研和商业领域的应用,降低了使用门槛,推动了数字生物学的商业应用。AlphaFold 数据库易于使用,降低了不同背景学者使用门槛,推动了数字生物学的商业应用。AlphaFold 新算法“attention”类似于人类潜意识,能够同时处理多个信息源,提高了数据处理能力和预测精度。AlphaFold 的成功离不开传统结构生物学家多年积累的数据和经验,是数据积累的质变。 AI 在生命科学领域的应用需要人工智能科学家和生物学家的合作。AlphaFold 提供高精度蛋白质结构预测,但并非所有预测结果都达到实验精度,仍需结合实验数据。AlphaFold 降低了研究者的时间成本,使其能够将更多精力放在蛋白质结构功能分析和下游应用上。不能仅用药物开发速度和数量来评价 AlphaFold 的贡献,需理性看待其在不同阶段的价值。AlphaFold 并非取代结构生物学家,而是解放了他们,使其能够专注于更高级别的研究。AlphaFold 的成功源于其巨大的数据量、资金投入和顶尖人才团队,这构成了高昂的进入门槛。AlphaFold 开源数据库为数字生物学奠定了基础,促进了下游应用的发展。AlphaFold 降低了数字生物学领域创业的门槛,促进了商业应用的发展。AlphaFold 数据库可用于开发软件工具,加速蛋白质特性研究和疾病研究。未来几年,数字生物学领域将涌现多个 AlphaFold 级别的创新,应用范围广泛。 国才:不必追求 AlphaFold 的竞品,其开源性已足够推动行业发展,更多团队应专注于下游应用。在未来三到五年内,药物研发领域将显著受益于 AlphaFold 的突破,尤其在临床前和早期临床阶段。AI 在药物研发中的应用存在矛盾点:计算科学与实验科学、高速迭代与慢工出细活的矛盾。AI 无法完全替代药物研发中的临床试验阶段,因为人体复杂性无法完全模拟。AI 有望解决制药行业研发成本高、周期长等痛点,并促进与科技巨头的合作。合成生物学领域有望出现下一个 AlphaFold 级别的突破,AI 与实验室自动化的结合将加速其发展。 张璐:DeepMind 的人力成本巨大,每年可能达到数亿美金。

Deep Dive

Chapters
This chapter explores the impact of AlphaFold on pharmaceutical research, discussing its role in accelerating drug discovery and development. Experts from Pfizer and Fusion Fund share their perspectives on AlphaFold's capabilities and limitations.
  • AlphaFold's impact on traditional drug development is significant, shifting the focus from experimental science to computational science and data-driven approaches.
  • AlphaFold's database is publicly accessible, lowering the barrier to entry for researchers and entrepreneurs.
  • The technology is already being applied in various fields, including vaccine development and tackling antibiotic resistance.

Shownotes Transcript

从 DeepMind 旗下人工智能 AlphaFold 诞生的那天,我们就有了这样一个疑问:人工智能会取代结构生物学家吗? 这个自上个世纪五十年代便开启探索之旅的学科,在算法的加持下,如今已翻天覆地的变化。著名结构生物学家、西湖大学校长施一公曾评价,「AlphaFold 是人工智能对科学领域最大的一次贡献」,但在 AlphaFold、ESMFold 以惊人的速度解锁地球上的蛋白质结构时,科学家们是否也会担心算法终将取代自己? 本期节目「What's Next|科技早知道」邀请硅谷投资人张璐和辉瑞研发部的国才,从投资与技术的视角,探讨 AlphaFold 在今年 7 月 28 日发布的最新研究成果,我们可以从哪些角度去理解 AI + 生命科学的意义,又如何看待这个阶段业内所面临的挑战。 温馨提示:本期节目录制于9月。

本期人物 刘灿,「科技早知道」监制 张璐,Fusion Fund 创始合伙人,硅谷投资人,世界经济论坛(达沃斯)全球青年领袖 国才,辉瑞研发部 药物科学肿瘤和免疫负责人

主要话题 [02:38] 人工智能在新药开发上的作用是? [14:30] AlphaFold 的功能被夸大了? [19:38] 科学家其实是被 AlphaFold 被解放了? [31:08] 这一类技术井喷的时间点是? [43:05] 新的技术热点会继续诞生?

延伸阅读

使用音乐 Purple Corals - Midnight Cycler

幕后制作 监制:刘灿、Nina、信宇 后期:赛德、迪卡普里鑫、Luke 运营:Babs、Yongxin、Bella 设计:饭团

关于节目 原「硅谷早知道」,全新改版后为「What's Next|科技早知道」。放眼全球,聚焦科技发展,关注商业格局变化。

声动胡同周年月系列活动) 11月12日 跟着「跳进兔子洞」采集声音故事) 11月19日 「科技早知道」带你上房揭瓦 11月22日-28日 请你来当一回「声动早咖啡」主编 12月1日 这次不想严肃的「声东击西 」,嘉宾由你来选**(投票开放中)**) 12月9日 串门儿线下终场派对

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Special Guests: 国才 and 张璐.