New lasso-shaped antibiotic kills drug-resistant bacteria
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自然。

欢迎回到自然播客。本周，我们将讨论一种具有抗生素潜力的套索状分子。还有一项大型研究试图解决人类如何影响生物多样性的争论。我是Sharmini Bandel。我是Benjamin Thompson。

抗生素是改变现代医学面貌的神奇药物。如果没有它们，我们许多习以为常的医疗程序都将无法进行。但是，迫切需要新的抗生素，因为我们目前使用的药物的耐药性不断上升，导致它们的疗效降低，甚至在某些情况下完全失效。

长期以来，耐药性并不是一个紧迫的问题，因为新的抗生素和新的抗生素类别一直在不断被发现，这些抗生素通常是由土壤中生存的细菌产生的。但自20世纪80年代以来，激增的抗生素发现渠道已经枯竭，放缓到此起彼伏的涓涓细流。更重要的是，抗生素本质上有一个内置的计时器，决定它们能保持多久的效用。

一旦耐药性发展并开始在细菌之间传播，这个计时器就开始倒计时。因此，寻找未来可能成为药物的新分子的工作变得刻不容缓。本周，《自然》杂志上，一个团队描述了他们发现的一种具有这种潜力的分子，该分子对多种细菌显示出有希望的抗生素活性。它被称为lariocidin，是一种被称为肽的短链氨基酸。

具体来说，它是一种被称为套索肽的分子。我打电话给Jerry Wright，他是这篇新论文的作者之一，他告诉我更多关于这项研究和套索肽的信息，包括它们是如何得名的。所以有一些非凡的结构。它不仅仅是一系列线性氨基酸，没有形状，

套索肽的作用是它们自身折叠，然后有一种酶在它们之间形成另一个肽键，这样它实际上将链的一部分穿过另一部分，并形成一个结。它形成一个看起来像套索的结构，我们从电视上的牛仔那里记得套索。这赋予套索肽非常稳定的，

稳定而独特的三维结构，自然界已经多次利用这种结构来开发这些具有各种生物学功能的小肽。其中一些是抗生素。而我们发现的这种lariocidin是我们所知的第一个靶向

细菌核糖体的套索肽，这是抗生素的一个主要靶点。有几十种不同的抗生素靶向核糖体，但我们从未见过这种肽这样做。那么，为什么核糖体是抗生素攻击的主要靶点呢？是的，如果你考虑一下细胞中哪些压力点能够杀死细胞，

你会说，核糖体是细胞内部的工厂，它实际上制造蛋白质和酶，这些蛋白质和酶对细胞的所有功能都是必不可少的。因此，如果你能阻止这种结构，那么你就会处于细胞无法生存和无法存活的境地。然后，关于你如何发现lariocidin的故事很有趣。我们知道，大量的抗生素是由土壤细菌产生的。这是一个寻找它们非常丰富的场所。

你以前也做过这个，但你是在一个非常非常长的时间框架内完成的。是的。在我的实验室里，我们开始从环境中收集细菌和真菌，主要是在加拿大。我实验室里的一位博士后认为，如果我们等待很长时间，等待……

那些否则很难在实验室里生长的生物在实验室里生长。所以他们去了我的技术员的后院，取了一份那里的泥土样本。没有什么令人兴奋的。对不住她，但这只是安大略省汉密尔顿的后院。

我们分离了一些细菌，然后把它们放在长凳下一年。一年后，他们打开盒子说，好吧，在这里我们将找到需要很长时间的生物，也许会有一些不寻常的生物。而我们从那个实验中培养出的那些生物之一是一种叫做pain of bacillus的生物。这只是一个

土壤生物，并不罕见，但它是不寻常的。而从这种pain of bacillus中，我们得到了lariocidin。所以通常情况下，我认为人们研究的是那些在培养皿中容易生长的东西。你颠倒了这一点，说，让我们寻找更微妙的东西，大多数没有一年时间等待的实验室不会去研究的东西。没错。我个人非常没有耐心。所以我不会自己做这个实验。

但是做这项工作的博士后做到了，结果是我们发现的。我认为这真的是一件非常聪明的事情。但这只是一个侦探故事的开始，对吧？你发现了这种细菌。你已经证明它产生了一些在实验室实验中可以杀死其他细菌的东西。但我认为你需要检查一下这是否不是以前已知的东西。你并没有重新发现已经存在的东西。

没错。这是抗生素发现中的关键任务。坦率地说，这也是为什么寻找新的抗生素如此具有挑战性的原因之一，因为我们一遍又一遍地不断发现旧的抗生素。它们在自然界中如此成功，以至于它们非常丰富且易于发现。事实上，我们发现的这种生物，这种pain of bacillus，实际上产生了一种旧的抗生素。

但我们开始做的是，采用这些生物体产生的化合物混合物，并使用我们称之为色谱法的过程将其分离。这帮助我们识别了这种否则我们永远不会发现的新抗生素。所以接下来的工作就是展示这种分子作用于什么。你已经证明它作用于核糖体，正如你所说，这是所有细胞的核心之一

对所有细胞来说，显然我们今天讨论的是细菌细胞，现在这被称为套索肽，我必须问一下，它是否像套索一样工作，它是否像套索一样缠绕在核糖体上，并挤压它的生命？哦，这是一个好问题，它不是，套索实际上赋予肽独特的3D结构，我们最终发现它结合到

我们称之为A位点的核糖体上的一个位点，它以一种非常特殊的方式在那里，干扰了从DNA编码的信息的正确翻译。显然，细菌非常擅长绕过我们扔给它们的任何东西，对吧？抗生素耐药性就是这样。有很多抗生素确实靶向核糖体，但对它们的耐药性很差。

显示。那么，细菌能否仅仅改变其核糖体的结构来避免这种套索肽呢？是的，事实证明，这很难做到，因为这种套索肽的结合位置。细菌很难以lariocidin不再与其结合的方式改变其核糖体。

我还想指出，我们没有看到与任何已知机制的交叉耐药性，包括我们所知的除这种之外的所有结合到核糖体的抗生素。

所以很难对这种抗生素产生耐药性。除了产生它的生物体之外，那里没有现有的耐药性，因为它对它有耐药性。在你的论文中，你谈到了对各种不同的细菌进行这种分子的测试，当然也有一些致病菌，在不同的途径中取得了各种成功。你知道，我们希望在抗生素中看到的一件事是，它不会区分细菌，它具有我们所说的广谱性。

事实证明，liriocidin确实具有这种表型。它对非常重要的细菌具有活性

所谓的革兰氏阳性致病菌，如金黄色葡萄球菌及其耐药版本，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌或耐甲氧西林金黄色葡萄球菌。它对非常重要的革兰氏阴性病原体具有活性，包括一种非常具有挑战性的生物体，称为鲍曼不动杆菌。而且我们没有看到它对人体细胞有任何毒性作用。

所以这是非常令人鼓舞的。它在涉及小鼠的实验中显示出一些有用的特性。没错。因此，我们能够证明lariocidin实际上能够治愈由这些非常具有挑战性的生物体之一，再次是鲍曼不动杆菌，在小鼠感染模型中引起的疾病。所以我们对此非常高兴，坦率地说。所以你有了这个分子，它显示出对抗

各种细菌。这项工作没有做什么？关于lariocidin还有哪些问题需要解答？坦白地说，本，发现部分很容易。现在需要付出很多努力才能将其转化为最终可以在人体临床试验中看到的东西。我们从土壤中发现的生物体几乎从未产生过一种将成为药物的分子。

所以我们现在正在做的是对lariocidin进行化学修饰，以试图改善其药物特性，以便我们可以鼓励

某家制药公司看到它的价值，然后将其进一步推向临床。但当然，在临床上，抗生素确实有有限的寿命。你谈到了在你的测试中耐药性很难获得。但当然，耐药性确实存在，因为产生它的细菌本身并没有死亡，正如你所说。

那么，如果这种分子最终成为一种药物，它的长期前景如何？你认为它是什么样的？坦白地说，我认为它非常好。产生pain to bacillus生物体用于自身耐药性的耐药机制是

没有很好的证据表明这很快就会被吸收并转移到病原体中。当然，耐药性总是不可避免的，但到目前为止，所有指标都表明这种抗生素确实有一些希望。而且，你知道，没有所谓的无耐药性抗生素，但这可能是一种低耐药性抗生素。来自加拿大麦克马斯特大学的Jerry Wright。

要阅读他的论文，请在节目说明中查找链接。接下来，一项对大量研究进行的大型研究试图弄清人类对生物多样性的确切影响。但现在，让我们来看一下Dan Fox带来的研究亮点。船舶排放的硫污染量减少，使地平线上出现了更清晰的天空，在世界上两个最繁忙的国际航运航道上，可以看到更少的风暴云和闪电。

之前的研究表明，污染会导致印度洋和南海繁忙航运航道沿线的风暴云和闪电。现在，研究人员分析了2020年1月前后这些地区的风暴云和闪电趋势，2020年1月是船用燃料中硫含量下降七倍的月份，这是对国际规定的回应。

他们的研究结果表明，2020年至2023年间，印度洋的闪电减少了76%，南海的闪电减少了47%，云水滴也出现了类似的下降。研究小组表示，这些结果对他们对气溶胶-云相互作用的理解具有根本性的意义。请在《大气化学与物理学》上阅读完整的这项研究。

鬣蜥在经历了8000公里长的海上航行后，成功地殖民了斐济——这是任何陆生脊椎动物已知的最长的海洋迁徙。不会飞也不会游泳的动物很难到达岛屿，但生物仍然设法通过依附在漂浮的残骸上找到了通往偏远前哨站的路——这种方法被称为漂流。

鬣蜥从南美洲大陆漂流到1000公里外的加拉帕戈斯群岛。然而，这些爬行动物是如何到达斐济的仍然是一个谜。为了了解斐济鬣蜥的起源，研究人员将它们的DNA与美洲鬣蜥的DNA进行了比较，发现它们与北美沙漠鬣蜥的亲缘关系最近。

基因组分析表明，这些谱系在大约3400万到3000万年前分离，这正是在火山活动形成斐济的时候，而这个时间暗示鬣蜥直接到达了斐济，而不是在几千年里从陆地到陆地缓慢跳跃。请前往美国国家科学院院刊阅读完整的这项研究。

接下来，记者Nick Petridge-Howe一直在研究人类对地球上所有生命多样性的影响。当你想到人类对自然世界的影响时，污染、砍伐森林和气候变化等事情在很大程度上是负面的，这并不令人惊讶。我们发现人类对生物多样性的影响，对丰富性的影响

是负面的，我认为这是可以预料的，对吧？这令人悲伤，令人震惊，但在某种程度上是可以预料的。这是Florian Altamatt，一位一直在研究这个主题的生态学家。但是，虽然总体情况可能并不令人惊讶，但这些影响究竟是如何影响生物多样性的却不太清楚。这就是Florian的用武之地。

他是本周发表在《自然》杂志上的一篇新的荟萃分析的作者。这项分析是一项大型研究，它仔细研究了数千项其他研究的结果，他一直在利用这项研究来汇集人类对生物多样性影响的综合知识，并试图填补一些未知数。例如，科学家们一直在争论人类活动对生物多样性的影响的细微之处。

一个问题是，由于人类的影响，生物群落的相似性或差异性如何变化。这对于保护以及动植物和生物为人类提供的益处等方面都可能产生重要的影响。通过进行这项荟萃分析，将所有已发表的资料汇集在一起，我认为我们可以回答这个问题。过去的研究对这个问题给出了相互矛盾的答案。

一些人说，生物多样性在局部范围内并没有真正发生变化，而另一些人则说恰恰相反。Floen认为，这种差异是因为许多研究忽略了包括良好的参考地点，在这种情况下，是指不受人类影响的世界地区。这些地区可以通过为研究人员提供比较和对比的东西来帮助显示人类对生物多样性的影响程度。

但是，考虑到人类对地球的影响有多大，寻找这些参考地点是一个挑战。最终，研究小组不得不仔细检查并丢弃许多没有这样做发表的研究。正如该论文的另一位作者Francois Keck所解释的那样。我们从超过70000项研究的集合开始。

然后我们减少了这个数字，只提取与我们的问题真正相关的研究。所以我们将其减少到超过2000项研究。所以这仍然是一个非常大的数字。我们必须手动完成这项工作。所以这是这项工作中相当大的一部分。最终的2133项研究涵盖了全球97783个地点。

它们每一个都包含了至关重要的参考条件，要么是直接实验，其中人类的影响在一个地点进行试验，而另一个地点则没有，要么是对未受影响的地点进行的观测数据。完成这项工作后，研究小组可以使用统计技术来结合这些论文的结果，以非常精细的细节来研究人类如何影响生物多样性。

研究小组的结果显示了几件事。正如Florian在开头提到的那样，他们发现总的来说，人类活动导致丰富度下降，即存在物种数量的减少，这可能是可以预料的。他们还表明，人类使生物群落发生变化，因此在人类影响的地点将存在不同的物种。

但是，当谈到我一开始提到的研究人员之间争论的主题时，即人类活动是否导致生物群落变得更相似（也称为同质性），或者变得更不同（也称为异质性），在这种情况下，嗯，这有点复杂。当这些群落变得更同质化或更少同质化时，结果会发生分歧。所以不是……

人类的影响总是使这些群落变得更同质，它也可能使它们变得更异质。我认为这确实是关键发现，即这取决于系统的特异性。因此，研究小组发现这完全取决于环境。当他们将所有数据放在一起观察时，看起来人类对生物多样性相似程度的影响很小。

但是，当你按不同的规模进行细分时，例如小于10米的微生境，一直到大陆大小的区域，那么就会有一些差异。在更大的尺度上，人类往往使事物变得更相似，而在较小的尺度上，则相反。

这项研究并没有研究为什么会发生这种情况，但一种解释可能是，在更大的尺度上，你往往会看到更多的人类四处移动动物并将它们引入新地方的影响，因此你可能总体上会有更多相似的物种。而在较小的尺度上，你往往会得到研究人员使用非常精细的梳子来观察哪些物种存在或不存在的研究，因此更有可能发现生物多样性的东西或变化。

这项分析还允许研究小组专门研究人类正在造成的不同影响。例如，他们可以专门研究污染或气候变化的影响。通过这样做，他们可以证明污染和栖息地变化正在造成一些对生物多样性最大的影响，导致物种损失最多。

虽然一些影响是可以预料的，但人类对生物多样性有很大的负面影响，研究小组对任何特定地点存在的物种数量因人类而发生变化的程度感到惊讶。最让我惊讶的是变化的规模，特别是如果我们考虑群落的构成。所以有些物种如何取代其他物种，

我预料到会有一些变化，显然，但规模确实很大。我认为这是最引人注目的结果。虽然荟萃分析中显示的许多影响是可以预料的，但这项研究是否解决了关于物种由于人类而变得更相似或更不相似的争论还有待观察。

例如，这项研究无法做到的一件事是确定为什么会发生这种情况。它只能表明人类活动与生物多样性变化之间存在联系。然而，总的来说，它描绘了一幅相当可怕的画面，说明人类对生物多样性造成了多大的破坏，物种普遍减少。

如果生物多样性是我们社会想要保护和保存的东西，那么我们就需要做得更好。Florian希望这个数据集能够在这里提供帮助，因为它通过提供如此详细的画面，显示某些影响在哪里以及有多大，它可以帮助规划未来集中保护工作的重点。我们有非常有力的证据表明这些压力产生了负面影响。这些通常是不希望对生物多样性产生的影响。所以这是

另一个非常有力的论据，即需要停止和减少这些压力，以阻止和扭转生物多样性的下降。那是Florian Altamatt。你还可以听到Francois Keck的声音。他们都是苏黎世大学和瑞士联邦水生科学与技术研究所的成员。有关该故事的更多信息，请查看节目说明中指向其论文的链接。最后，在节目中，是简报聊天时间，我们将讨论在

自然简报中重点介绍的几篇文章。Sharmini，为什么你不先来呢？你本周读了什么？是的，这是关于智利一些事情的《自然》杂志上的一篇非常有趣的文章。并且在智利北部的阿塔卡马沙漠中，有一群望远镜，非常大，非常大，极有可能非常大，以及他们想要建造的这个拟议中的绿色氢能综合体之间，存在着某种潜在的冲突。

它们似乎是两件完全不同的事情。冲突是什么？这是一个空间问题，真的。所以你有阿塔卡马沙漠，对吧？欧洲南方天文台在那里有一个天文台，他们正在建造更多的大型望远镜，有很多非常令人兴奋的科学潜力。这个沙漠之所以适合这个，是因为它非常黑暗……

所以，显然，如果你正在观察非常微弱的遥远恒星，那么越暗越好。其中一个被称为甚大望远镜的位置，可能是最黑暗的地方之一。对。你想远离人群。你想远离光污染。你想远离振动。所以，沙漠非常适合这个。沙漠也很多风，阳光充足，这意味着……

可能非常适合太阳能电池板和风力涡轮机。因此，这家能源公司计划建造一个大型综合体，他们可以在那里利用太阳能和风能从海水中获取氢气。所以是绿色氢气。但是这个巨大的综合体，它将有一个港口。它将拥有制氢厂、氨生产厂。它将拥有数千个发电机。

它会产生光，它会产生振动，欧洲南方天文台目前表示，这对我们来说将是一个巨大的问题，我的意思是，作为一个住在伦敦南部的人，总是错过太空中的酷炫事物，哦，你看到了肉眼可见的彗星吗？不，我看到的只是橙色的光芒，你看到了所有的行星吗？不，我看到的只是橙色的光芒，你可以看到这将是一个潜在的问题，那么目前的现状是什么呢？好吧，

好吧，有点混乱，因为欧洲南方天文台刚刚发布了这项分析。你知道，他们正在研究这个综合体的潜在影响是什么。从他们的角度来看，情况看起来非常暗淡。他们说，现有的甚大望远镜的光污染将至少增加35%。并且，在他们正在切伦科夫望远镜阵列天文台建造的另一个地点，光污染可能会增加55%。所以很大

很大的问题。该项目的大气湍流也可能导致振动，从而损坏设备。他们对此并不乐观。例如，他们的代表在媒体简报会上说，“毁灭性的不可逆转的损害”一词，它将达到我们很可能无法操作这些望远镜的地步。对。但能源公司已经做了分析。

当他们提出这个计划时，当他们基本上说，这是我们的计划，但我们将遵守智利的法规时，他们的分析说，好吧，我们认为甚大望远镜的光污染将增加0.27%，切伦科夫望远镜阵列天文台的光污染将增加0.45%。所以……

他们的数字真的不一样。他们对此的反应基本上是，哦，我们不知道为什么这些数字不一样。我们将不得不去调查一下。他们说他们仍在收集来自欧洲南方天文台文件的资料，以了解两者之间的差异。

这两个数字集之间的差异，基本上。所以我想双方都在等待这份新报告，然后再采取任何措施或进行更多讨论？是的，有一个机构必须对此做出裁决。因此，智利环境评估服务机构基本上必须决定这个能源项目是否可以继续进行。

我感觉这并非一定是可以预测的，因为能源公司和欧洲南方天文台一直在合作制定阵列的计划。所以显然他们正在讨论照明设计将如何工作。该公司就此征求了他们的意见。

但这并不是这家能源公司面临的唯一反对意见。附近一个城镇的一个地区政府机构已经提出了反对意见，基本上说这有很多问题，我们应该拒绝它，你应该在其他地方重新开始。从欧洲南方天文台的角度来看，问题仍然是位置，因为它与正在建设的许多其他项目相比，非常接近。它确实非常接近，距离切伦科夫望远镜阵列不到5公里。但是当然……

人们认为绿色氢气可以在未来的能源使用中发挥重要作用。因此，获得清洁能源来源是人类最终需要的。是的。而且，你知道，我认为这些天文学家都没有反对绿色能源生产。所以这个具体的项目可以……

每年节省150万吨二氧化碳排放量。然后是当地的影响。它将创造大约5000个就业岗位。例如，这对智利的经济增长有很多好处。我认为问题在于位置，天文学家正在努力保护他们所拥有的独特的东西。欧洲南方天文台总干事指出，我们在这里失去的东西在世界其他任何地方都无法替代。好吧，

好吧，我相信我们会密切关注这件事，看看这个结是如何解开的。但是让我们把沙漠的酷热留给本周我得到的一个酷炫故事。它很酷，因为它在南极洲，它是我在《科学美国人》杂志上读到的东西，它关注的是极端环境下的生命。哦，我喜欢这个。这让我想到所有旧的戴维·阿滕伯勒BBC自然纪录片，在那里你去……

一个冰冷的雪地沙漠，什么都没有，然后就像这个小块实际上充满了……它充满了什么？好吧，让我们来看看。所以我们实际上是在这里潜入水中，Sharmini。现在，生命遍布地球的海洋和海域，从地表到……最深处，但在一个很难知道发生了什么的地方突然变得

可用，那就是南极洲巨大的漂浮冰盖下面的海底。哦，所以通常完全被冰覆盖的海底。对，正如你可能想象的那样，这是一个非常难以到达的地方，并且

它之所以变得更容易到达，是因为在一月份，一座像芝加哥一样大的冰山——我不知道芝加哥到底有多大，但我猜想相当大，对吧？——它实际上从别林斯高晋海的一个冰架上断裂了。现在，附近有一组研究人员乘船前往南极洲，研究附近的洋底，观察生态系统以及它们如何受到气候变化的影响，诸如此类的事情，对吧？是的。

但随后突然发生了这件事，他们就像，“让我们去吧。让我们做这种事情。”因为文章中说这是一个非常难得的机会。这有点像在森林里翻动一根木头。我正要说的是，当你抬起木头时，突然所有的虫子都像，“救命”。

但事实证明，在这种情况下，这根木头是一座像芝加哥一样大的冰山。好的，所以他们去了那里，开始研究这个，其中一件这种偶然的事情。他们发现了许多生命。文章中引用的一位研究人员说，那里有

惊讶地看到了他们所发现的生命数量。它与他们已经了解的海底部分相比如何？嗯，以前对冰层下进行的研究涉及钻孔并将摄像机放入其中，或者观察冰山崩裂的区域，但在很久之后，对吧？所以很难在

它发生的那一刻到达那里。他们发现了大量的东西，大量的新物种。他们派下一艘潜艇，这种奇怪的 anemones、海蜘蛛、章鱼。是的，许多这些都被认为是

是新物种。显然，要弄清楚这一点需要付出很多努力。但人们也认为，其中一些物种可能只能在这里找到，因为南极洲被这种非常特殊的洋流包围着，文章中将其描述为围绕城堡的护城河。所以它

需要数年时间才能描述所有这些物种，但其中一种特别引人注目，并且有一张图片，听众们，你们应该去看一看。我们将在节目说明中添加文章链接。它是一种看起来像花瓶的海绵，我想。研究人员估计它可能有几十年的历史，甚至可能几百年的历史，尽管尚未对其进行分析。所以似乎这是一个繁荣的、多样化的生态系统

在这个非常难以到达的地方，研究人员以前并没有很好的机会观察到。我的意思是，对于那些研究人员来说，冰山正好在那时崩裂，并能够描述大量新物种，真是幸运。所以，就像翻动木头一样，冰山就这样离开了，这是一个问题吗？

这是一个很好的问题。我想这还有待观察，因为这个冰盖下面的空间是一个如此特殊的生态系统，动物确实专门生活在它们居住的地方。突然掀开盖子就像……

好吧，这还有待观察。正如我所说，以前的一些研究表明那里的多样性较低。南极洲的冰盖正在消退。因此，我认为这个故事表明，仍然有大量的动物多样性和生态系统有待发现。但正如我们在尼克的故事中听到的那样……

人类活动确实正在影响这些。所以这有点像一场与时间赛跑，在我们仍然可以的时候了解更多信息。这很有趣，因为你经常听到与地球上其他任何地方相比，海底的探索程度如此之低。但我从未真正考虑过这样一个事实，即海底有很多生命，只是……

在冰层下面，很难到达。100%。所以这真的很令人感兴趣。好吧，正如你所说，我们将把我们今天讨论过的这两篇文章的链接放在节目说明中。你可以在那里找到它们。我们还将添加一个链接，你可以在那里注册 Nature Briefing，以便你可以收到更多此类故事，但会发送到你的电子邮件收件箱中。这就是本周的全部内容。如果你想保持联系，我们在 X 和 Blue Sky 上，或者你可以发送电子邮件到 [email protected]。我是本杰明·汤普森。我是沙米莉·邦德尔。感谢收听。

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耶路撒冷是圣周。人群欢迎耶稣为王。

叛乱在空气中。耶稣在我们管辖范围之外运作。罗马将降临在我们所有人身上。但耶稣并没有夺取王位，而是扭转了局面。我的房子将被称为祈祷的房子，但你们却把它变成贼窝。世界将永远不会相同。即将在影院上映。《拣选者最后的晚餐》。立即购票。