像海顿一样，莫扎特在其成熟年代处理交响曲时也是十分严肃的。他在生命的最后十年中只写了六首，而在此前却写了近六十首。他把很多时间和精力都致力于这种作品。一七八二年以前写的交响曲多半充作音乐会或戏剧的开幕曲。定居维也纳以后创作的那些则成为音乐会节目单中的重要部分，或者至少可以与协奏曲和咏叹调分享名次。哈佛纳交响曲写于一七八二年，是为莫扎特童年时的友人西哥蒙德哈佛纳提升为贵族而创作的。林茨交响曲写于一七八三年，是为该城的一次演出而作。它反映了晚期交响曲的特点，表现在规模的宏大，对演奏者特别是管乐演奏者的更多要求，和声与对位的复杂和半音化，以及墨乐章激动人心而不是轻松愉快的情绪。这些交响曲在各方面都像海顿的伦敦交响曲一样精巧，而且其中的某几首的确可以成为那位老一代作曲家的楷模。这一组的另外几首被认为是他最伟大的作品，是一七八六年的D大调布拉格交响曲，以及降义大调记小调和C大调。C大调交响曲是由一位英国出版商命名的，称之为朱比特。后三首创作于一七八八年夏天的六周时间中
